Raziskovalci iz Kitajske in Nemčije so prvič v celoti dešifrirali krompirjev genom, poroča TASS. To jim je pomagalo razkriti evolucijsko zgodovino te rastline in poudariti ključne regije DNK, povezane z rastjo in odpornostjo na bolezni. Informacijo o tem je objavila tiskovna služba Nemškega inštituta za gojenje rastlin (IPZ).
"Zaporedje krompirjevega genoma nam bo omogočilo, da začnemo z visoko zmogljivimi žlahtniškimi programi, ki bodo ustvarili nove sorte, ki so visoko donosne, a odporne na globalno segrevanje, kar bo kritično v prihodnjih desetletjih," je dejal profesor IPZ Korbinian Schneeberger.
Pri gojenju krompirja ovirajo številne glivične in bakterijske bolezni, pa tudi različni škodljivci, kot so koloradski hrošč in ogorčice. Znanstveniki in rejci se z njimi poskušajo boriti z ustvarjanjem novih sort konvencionalnega in gensko spremenjenega krompirja.
Profesor Schneeberger in njegovi sodelavci so prišli do potencialne rešitve tega problema v obsežnem projektu, katerega cilj je popolno sekvenciranje krompirjevega genoma. V preteklosti so znanstveniki že poskušali pridobiti te podatke, a je to ovirala izjemno kompleksna struktura krompirjevega genoma – sestavljen je iz štirih enakih nizov kromosomov, ki vsebujejo veliko število ponovitev.
Nove tehnologije zaporedja DNK in algoritmi za analizo genetskih informacij so nemškim in kitajskim genetikom pomagali rešiti ta problem za sorto Otava. Za dešifriranje genoma so znanstveniki zbrali veliko število cvetnega prahu, katerih genski material vsebuje le dve, ne štiri kopije kromosomov.
Ta pristop je močno poenostavil nalogo, hkrati pa je zahteval dekodiranje zelo velikega števila fragmentov DNK in njihovo kasnejšo kombinacijo z uporabo računalniških algoritmov. Na koncu so znanstveniki pridobili virtualno kopijo celotnega krompirjevega genoma, ki je sestavljen iz približno 3,1 milijarde genetskih "črk" - nukleotidov in vsebuje več kot 38 genov.
Kasnejša analiza njihove strukture je razkrila zapleteno evolucijsko zgodovino krompirja. Znanstveniki so ugotovili, da je ta kultura razmeroma nedavno preživela podvojitev genoma zaradi sorodstvenega parjenja. Poleg tega so znanstveniki odkrili nenavadne razlike v ravni aktivnosti kopij istih genov, ki se nahajajo na različnih kromosomih, kar bi lahko vplivalo na učinkovitost križanja različnih sort krompirja.
Znanstveniki upajo, da bodo te informacije pomagale pri vzreji novih sort ali modificiranju genoma tako, da bo krompir hitreje rasel, se bo bolje upiral pozni ožigi in drugim boleznim ter bo tudi manj dovzeten za različne stresne dejavnike.